Dabartinė mūrinė Barzdų bažnyčia pradėta statyti 1930 metais pagal pirminį inžinieriaus Vaclovo Michnevičiaus projektą, tačiau netrukus dėl parapiją slegiančių skolų ir statybinių medžiagų stygiaus buvo perprojektuota. 1934 metais šventovę baigė statyti klebonas Stanislovas Mikelkevičius. Kitais metais Juozas Dobkevičius dekoravo jos vidų ir pastatė Didįjį altorių. Iš išardytos medinės koplyčios statybinių medžiagų buvo pastatyta parapijos prieglauda. Po Antrojo pasaulinio karo klebonas Vincas Čėsna bažnyčią suremontavo, perdažė ir išpuošė. Nuo 2004 metų, mirus čia net 31 metus klebonavusiam kunigui Jonui Būgai, Barzdų parapiją aptarnauja Griškabūdžio kunigai.
Bažnyčios pastatymo 80 – mečio proga Šv. Mišias čia aukojo Vilkaviškio vyskupas Rimantas Norvila. Jam patarnavo Griškabūdžio klebonas Vytautas Mazirskas, Kudirkos Naumiesčio klebonas kanauninkas Donatas Jasulaitis ir kiti kunigai. Barzdų krašto tikinčiuosius šią šventinę dieną sveikino rajono savivaldybės meras Juozas Bertašius, Seimo narys Mindaugas Bastys, Barzdų seniūnas Remigijus Naujokaitis.